Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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PRKD1Q15139 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
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PRKD1Q15139 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
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PRKD1Q15139 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
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