Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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PDK3Q15120 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
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