Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
R3HDM1Q15032 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
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