Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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COL19A1Q14993 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL19A1Q14993 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL19A1Q14993 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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COL19A1Q14993 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL19A1Q14993 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL19A1Q14993 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
COL19A1Q14993 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL19A1Q14993 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL19A1Q14993 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
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COL19A1Q14993 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL19A1Q14993 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL19A1Q14993 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL19A1Q14993 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL19A1Q14993 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
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COL19A1Q14993 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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COL19A1Q14993 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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COL19A1Q14993 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL19A1Q14993 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL19A1Q14993 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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COL19A1Q14993 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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COL19A1Q14993 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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COL19A1Q14993 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL19A1Q14993 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL19A1Q14993 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL19A1Q14993 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL19A1Q14993 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL19A1Q14993 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL19A1Q14993 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL19A1Q14993 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL19A1Q14993 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL19A1Q14993 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL19A1Q14993 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL19A1Q14993 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL19A1Q14993 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL19A1Q14993 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL19A1Q14993 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL19A1Q14993 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL19A1Q14993 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL19A1Q14993 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
COL19A1Q14993 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
COL19A1Q14993 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL19A1Q14993 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
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