Protein–RNA interactions for Protein: Q14590

ZNF235, Zinc finger protein 235, humanhuman

Predictions only

Length 738 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF235Q14590 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF235Q14590 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF235Q14590 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF235Q14590 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF235Q14590 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF235Q14590 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF235Q14590 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF235Q14590 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF235Q14590 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF235Q14590 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF235Q14590 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF235Q14590 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF235Q14590 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF235Q14590 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF235Q14590 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF235Q14590 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF235Q14590 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF235Q14590 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF235Q14590 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF235Q14590 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF235Q14590 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF235Q14590 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF235Q14590 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF235Q14590 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF235Q14590 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF235Q14590 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF235Q14590 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF235Q14590 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF235Q14590 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF235Q14590 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF235Q14590 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF235Q14590 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF235Q14590 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF235Q14590 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF235Q14590 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF235Q14590 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF235Q14590 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF235Q14590 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF235Q14590 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF235Q14590 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF235Q14590 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF235Q14590 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF235Q14590 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF235Q14590 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF235Q14590 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF235Q14590 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF235Q14590 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF235Q14590 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF235Q14590 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF235Q14590 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF235Q14590 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF235Q14590 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF235Q14590 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF235Q14590 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF235Q14590 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF235Q14590 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF235Q14590 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF235Q14590 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF235Q14590 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF235Q14590 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF235Q14590 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF235Q14590 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF235Q14590 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF235Q14590 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF235Q14590 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF235Q14590 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF235Q14590 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF235Q14590 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF235Q14590 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF235Q14590 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF235Q14590 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF235Q14590 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF235Q14590 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF235Q14590 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF235Q14590 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF235Q14590 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF235Q14590 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF235Q14590 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF235Q14590 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF235Q14590 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF235Q14590 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF235Q14590 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF235Q14590 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF235Q14590 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF235Q14590 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF235Q14590 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF235Q14590 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF235Q14590 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF235Q14590 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF235Q14590 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF235Q14590 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF235Q14590 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF235Q14590 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF235Q14590 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF235Q14590 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF235Q14590 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF235Q14590 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF235Q14590 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF235Q14590 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF235Q14590 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms