Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

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Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SQLEQ14534 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
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