Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms