Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL9A3Q14050 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
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