Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DDX39BQ13838 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
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