Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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