Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TOP3AQ13472 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TOP3AQ13472 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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