Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

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Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
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SEMA3BQ13214 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA3BQ13214 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
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