Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF1Q13077 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
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