Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms