Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
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NPRL3Q12980 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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NPRL3Q12980 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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NPRL3Q12980 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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NPRL3Q12980 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
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NPRL3Q12980 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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NPRL3Q12980 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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NPRL3Q12980 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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NPRL3Q12980 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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NPRL3Q12980 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
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NPRL3Q12980 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NPRL3Q12980 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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