Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms