Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1BQ00975 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms