Protein–RNA interactions for Protein: P80192

MAP3K9, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K9P80192 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MAP3K9P80192 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MAP3K9P80192 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MAP3K9P80192 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MAP3K9P80192 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MAP3K9P80192 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MAP3K9P80192 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MAP3K9P80192 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MAP3K9P80192 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MAP3K9P80192 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MAP3K9P80192 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MAP3K9P80192 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
MAP3K9P80192 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
MAP3K9P80192 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
MAP3K9P80192 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
MAP3K9P80192 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MAP3K9P80192 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MAP3K9P80192 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MAP3K9P80192 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MAP3K9P80192 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MAP3K9P80192 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MAP3K9P80192 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MAP3K9P80192 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MAP3K9P80192 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MAP3K9P80192 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MAP3K9P80192 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MAP3K9P80192 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MAP3K9P80192 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MAP3K9P80192 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MAP3K9P80192 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MAP3K9P80192 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MAP3K9P80192 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MAP3K9P80192 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MAP3K9P80192 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MAP3K9P80192 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MAP3K9P80192 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MAP3K9P80192 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MAP3K9P80192 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MAP3K9P80192 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
MAP3K9P80192 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MAP3K9P80192 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MAP3K9P80192 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MAP3K9P80192 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
MAP3K9P80192 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MAP3K9P80192 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MAP3K9P80192 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MAP3K9P80192 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MAP3K9P80192 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MAP3K9P80192 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
MAP3K9P80192 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MAP3K9P80192 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MAP3K9P80192 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MAP3K9P80192 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MAP3K9P80192 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MAP3K9P80192 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
MAP3K9P80192 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MAP3K9P80192 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MAP3K9P80192 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MAP3K9P80192 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
MAP3K9P80192 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MAP3K9P80192 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MAP3K9P80192 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MAP3K9P80192 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MAP3K9P80192 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MAP3K9P80192 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MAP3K9P80192 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MAP3K9P80192 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
MAP3K9P80192 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MAP3K9P80192 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
MAP3K9P80192 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MAP3K9P80192 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MAP3K9P80192 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MAP3K9P80192 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MAP3K9P80192 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MAP3K9P80192 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MAP3K9P80192 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MAP3K9P80192 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MAP3K9P80192 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MAP3K9P80192 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
MAP3K9P80192 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MAP3K9P80192 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MAP3K9P80192 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MAP3K9P80192 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MAP3K9P80192 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MAP3K9P80192 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
MAP3K9P80192 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MAP3K9P80192 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MAP3K9P80192 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MAP3K9P80192 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MAP3K9P80192 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MAP3K9P80192 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MAP3K9P80192 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MAP3K9P80192 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MAP3K9P80192 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MAP3K9P80192 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MAP3K9P80192 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MAP3K9P80192 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MAP3K9P80192 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MAP3K9P80192 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MAP3K9P80192 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms