Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SH3BGRP55822 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SH3BGRP55822 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SH3BGRP55822 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SH3BGRP55822 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SH3BGRP55822 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SH3BGRP55822 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SH3BGRP55822 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SH3BGRP55822 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SH3BGRP55822 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SH3BGRP55822 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SH3BGRP55822 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SH3BGRP55822 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SH3BGRP55822 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SH3BGRP55822 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SH3BGRP55822 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SH3BGRP55822 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SH3BGRP55822 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SH3BGRP55822 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SH3BGRP55822 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SH3BGRP55822 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SH3BGRP55822 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SH3BGRP55822 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SH3BGRP55822 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SH3BGRP55822 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SH3BGRP55822 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SH3BGRP55822 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SH3BGRP55822 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SH3BGRP55822 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SH3BGRP55822 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SH3BGRP55822 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SH3BGRP55822 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SH3BGRP55822 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SH3BGRP55822 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SH3BGRP55822 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SH3BGRP55822 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SH3BGRP55822 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SH3BGRP55822 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SH3BGRP55822 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SH3BGRP55822 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SH3BGRP55822 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SH3BGRP55822 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SH3BGRP55822 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SH3BGRP55822 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SH3BGRP55822 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SH3BGRP55822 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SH3BGRP55822 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SH3BGRP55822 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SH3BGRP55822 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SH3BGRP55822 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SH3BGRP55822 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SH3BGRP55822 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SH3BGRP55822 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SH3BGRP55822 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SH3BGRP55822 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SH3BGRP55822 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SH3BGRP55822 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SH3BGRP55822 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SH3BGRP55822 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SH3BGRP55822 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SH3BGRP55822 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SH3BGRP55822 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SH3BGRP55822 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SH3BGRP55822 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SH3BGRP55822 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SH3BGRP55822 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SH3BGRP55822 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SH3BGRP55822 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SH3BGRP55822 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SH3BGRP55822 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SH3BGRP55822 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SH3BGRP55822 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SH3BGRP55822 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SH3BGRP55822 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SH3BGRP55822 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SH3BGRP55822 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SH3BGRP55822 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SH3BGRP55822 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SH3BGRP55822 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SH3BGRP55822 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SH3BGRP55822 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SH3BGRP55822 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SH3BGRP55822 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SH3BGRP55822 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SH3BGRP55822 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SH3BGRP55822 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SH3BGRP55822 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SH3BGRP55822 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SH3BGRP55822 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SH3BGRP55822 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SH3BGRP55822 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SH3BGRP55822 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SH3BGRP55822 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SH3BGRP55822 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SH3BGRP55822 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SH3BGRP55822 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SH3BGRP55822 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SH3BGRP55822 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SH3BGRP55822 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SH3BGRP55822 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
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