Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
FNTBP49356 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
FNTBP49356 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FNTBP49356 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FNTBP49356 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FNTBP49356 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FNTBP49356 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FNTBP49356 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FNTBP49356 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FNTBP49356 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FNTBP49356 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FNTBP49356 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
FNTBP49356 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FNTBP49356 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FNTBP49356 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FNTBP49356 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FNTBP49356 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FNTBP49356 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FNTBP49356 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FNTBP49356 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FNTBP49356 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FNTBP49356 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FNTBP49356 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FNTBP49356 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FNTBP49356 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FNTBP49356 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FNTBP49356 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FNTBP49356 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FNTBP49356 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FNTBP49356 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FNTBP49356 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FNTBP49356 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FNTBP49356 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FNTBP49356 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FNTBP49356 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FNTBP49356 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FNTBP49356 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FNTBP49356 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FNTBP49356 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FNTBP49356 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
FNTBP49356 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FNTBP49356 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FNTBP49356 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FNTBP49356 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FNTBP49356 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FNTBP49356 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FNTBP49356 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FNTBP49356 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FNTBP49356 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FNTBP49356 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FNTBP49356 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FNTBP49356 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FNTBP49356 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FNTBP49356 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FNTBP49356 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FNTBP49356 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FNTBP49356 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
FNTBP49356 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FNTBP49356 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FNTBP49356 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FNTBP49356 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
FNTBP49356 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FNTBP49356 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FNTBP49356 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FNTBP49356 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FNTBP49356 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
FNTBP49356 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FNTBP49356 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FNTBP49356 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FNTBP49356 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FNTBP49356 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FNTBP49356 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FNTBP49356 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FNTBP49356 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FNTBP49356 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FNTBP49356 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FNTBP49356 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FNTBP49356 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FNTBP49356 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FNTBP49356 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FNTBP49356 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FNTBP49356 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FNTBP49356 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FNTBP49356 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FNTBP49356 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FNTBP49356 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FNTBP49356 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FNTBP49356 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FNTBP49356 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FNTBP49356 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FNTBP49356 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FNTBP49356 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FNTBP49356 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FNTBP49356 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FNTBP49356 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FNTBP49356 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FNTBP49356 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
FNTBP49356 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
FNTBP49356 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FNTBP49356 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms