Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LTBRP36941 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LTBRP36941 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LTBRP36941 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LTBRP36941 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LTBRP36941 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LTBRP36941 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LTBRP36941 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LTBRP36941 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LTBRP36941 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LTBRP36941 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LTBRP36941 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LTBRP36941 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LTBRP36941 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LTBRP36941 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LTBRP36941 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LTBRP36941 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LTBRP36941 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LTBRP36941 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LTBRP36941 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LTBRP36941 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LTBRP36941 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LTBRP36941 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LTBRP36941 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LTBRP36941 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LTBRP36941 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LTBRP36941 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LTBRP36941 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LTBRP36941 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LTBRP36941 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LTBRP36941 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LTBRP36941 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LTBRP36941 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LTBRP36941 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LTBRP36941 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LTBRP36941 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LTBRP36941 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LTBRP36941 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LTBRP36941 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LTBRP36941 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LTBRP36941 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LTBRP36941 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LTBRP36941 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LTBRP36941 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LTBRP36941 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LTBRP36941 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LTBRP36941 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LTBRP36941 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LTBRP36941 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LTBRP36941 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LTBRP36941 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LTBRP36941 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LTBRP36941 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LTBRP36941 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LTBRP36941 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LTBRP36941 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LTBRP36941 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LTBRP36941 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LTBRP36941 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LTBRP36941 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LTBRP36941 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LTBRP36941 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LTBRP36941 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LTBRP36941 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LTBRP36941 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LTBRP36941 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LTBRP36941 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LTBRP36941 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LTBRP36941 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LTBRP36941 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LTBRP36941 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LTBRP36941 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LTBRP36941 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LTBRP36941 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LTBRP36941 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LTBRP36941 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LTBRP36941 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LTBRP36941 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LTBRP36941 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LTBRP36941 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LTBRP36941 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LTBRP36941 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LTBRP36941 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LTBRP36941 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LTBRP36941 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LTBRP36941 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LTBRP36941 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LTBRP36941 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LTBRP36941 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LTBRP36941 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LTBRP36941 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LTBRP36941 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LTBRP36941 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LTBRP36941 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LTBRP36941 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LTBRP36941 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LTBRP36941 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LTBRP36941 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LTBRP36941 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LTBRP36941 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms