Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CPS1P31327 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CPS1P31327 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CPS1P31327 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CPS1P31327 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CPS1P31327 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CPS1P31327 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CPS1P31327 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CPS1P31327 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CPS1P31327 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CPS1P31327 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CPS1P31327 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CPS1P31327 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CPS1P31327 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CPS1P31327 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CPS1P31327 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CPS1P31327 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CPS1P31327 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CPS1P31327 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CPS1P31327 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.56
CPS1P31327 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CPS1P31327 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CPS1P31327 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CPS1P31327 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CPS1P31327 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CPS1P31327 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CPS1P31327 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CPS1P31327 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CPS1P31327 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CPS1P31327 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CPS1P31327 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CPS1P31327 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CPS1P31327 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CPS1P31327 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CPS1P31327 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CPS1P31327 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CPS1P31327 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CPS1P31327 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CPS1P31327 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CPS1P31327 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CPS1P31327 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CPS1P31327 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CPS1P31327 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CPS1P31327 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CPS1P31327 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CPS1P31327 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CPS1P31327 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CPS1P31327 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CPS1P31327 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CPS1P31327 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CPS1P31327 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CPS1P31327 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CPS1P31327 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CPS1P31327 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CPS1P31327 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CPS1P31327 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CPS1P31327 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CPS1P31327 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CPS1P31327 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CPS1P31327 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CPS1P31327 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CPS1P31327 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CPS1P31327 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CPS1P31327 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CPS1P31327 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CPS1P31327 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CPS1P31327 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CPS1P31327 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CPS1P31327 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CPS1P31327 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CPS1P31327 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CPS1P31327 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CPS1P31327 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CPS1P31327 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CPS1P31327 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CPS1P31327 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CPS1P31327 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CPS1P31327 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CPS1P31327 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CPS1P31327 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CPS1P31327 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CPS1P31327 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CPS1P31327 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CPS1P31327 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CPS1P31327 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CPS1P31327 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CPS1P31327 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CPS1P31327 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CPS1P31327 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CPS1P31327 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CPS1P31327 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CPS1P31327 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CPS1P31327 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CPS1P31327 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CPS1P31327 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CPS1P31327 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CPS1P31327 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CPS1P31327 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CPS1P31327 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CPS1P31327 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms