Protein–RNA interactions for Protein: P30084

ECHS1, Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1P30084 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ECHS1P30084 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ECHS1P30084 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ECHS1P30084 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ECHS1P30084 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ECHS1P30084 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ECHS1P30084 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ECHS1P30084 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ECHS1P30084 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ECHS1P30084 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ECHS1P30084 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ECHS1P30084 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ECHS1P30084 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ECHS1P30084 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ECHS1P30084 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ECHS1P30084 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ECHS1P30084 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ECHS1P30084 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ECHS1P30084 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ECHS1P30084 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ECHS1P30084 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ECHS1P30084 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ECHS1P30084 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ECHS1P30084 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ECHS1P30084 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ECHS1P30084 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ECHS1P30084 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ECHS1P30084 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ECHS1P30084 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ECHS1P30084 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ECHS1P30084 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ECHS1P30084 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ECHS1P30084 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ECHS1P30084 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ECHS1P30084 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ECHS1P30084 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
ECHS1P30084 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ECHS1P30084 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ECHS1P30084 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ECHS1P30084 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ECHS1P30084 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ECHS1P30084 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ECHS1P30084 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ECHS1P30084 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ECHS1P30084 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ECHS1P30084 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ECHS1P30084 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ECHS1P30084 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ECHS1P30084 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ECHS1P30084 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ECHS1P30084 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ECHS1P30084 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ECHS1P30084 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ECHS1P30084 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ECHS1P30084 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ECHS1P30084 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ECHS1P30084 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ECHS1P30084 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ECHS1P30084 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ECHS1P30084 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ECHS1P30084 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ECHS1P30084 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ECHS1P30084 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ECHS1P30084 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ECHS1P30084 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ECHS1P30084 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ECHS1P30084 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ECHS1P30084 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ECHS1P30084 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ECHS1P30084 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ECHS1P30084 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ECHS1P30084 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ECHS1P30084 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ECHS1P30084 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ECHS1P30084 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ECHS1P30084 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ECHS1P30084 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ECHS1P30084 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ECHS1P30084 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ECHS1P30084 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ECHS1P30084 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ECHS1P30084 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ECHS1P30084 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ECHS1P30084 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ECHS1P30084 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ECHS1P30084 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ECHS1P30084 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ECHS1P30084 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ECHS1P30084 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ECHS1P30084 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ECHS1P30084 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ECHS1P30084 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ECHS1P30084 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ECHS1P30084 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ECHS1P30084 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ECHS1P30084 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ECHS1P30084 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ECHS1P30084 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ECHS1P30084 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ECHS1P30084 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms