Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXD10P28358 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms