Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPREP23469 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPREP23469 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPREP23469 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPREP23469 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPREP23469 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPREP23469 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPREP23469 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPREP23469 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPREP23469 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPREP23469 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPREP23469 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPREP23469 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPREP23469 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPREP23469 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPREP23469 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPREP23469 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPREP23469 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPREP23469 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPREP23469 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPREP23469 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPREP23469 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPREP23469 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPREP23469 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPREP23469 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPREP23469 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPREP23469 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PTPREP23469 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PTPREP23469 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PTPREP23469 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PTPREP23469 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PTPREP23469 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PTPREP23469 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPREP23469 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPREP23469 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPREP23469 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPREP23469 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPREP23469 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPREP23469 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPREP23469 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPREP23469 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPREP23469 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPREP23469 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPREP23469 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPREP23469 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPREP23469 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPREP23469 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPREP23469 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPREP23469 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPREP23469 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPREP23469 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPREP23469 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPREP23469 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPREP23469 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPREP23469 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPREP23469 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPREP23469 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPREP23469 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPREP23469 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPREP23469 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPREP23469 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPREP23469 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPREP23469 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPREP23469 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPREP23469 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPREP23469 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPREP23469 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPREP23469 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPREP23469 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPREP23469 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPREP23469 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPREP23469 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPREP23469 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPREP23469 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPREP23469 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPREP23469 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPREP23469 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPREP23469 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPREP23469 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPREP23469 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPREP23469 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPREP23469 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPREP23469 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPREP23469 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPREP23469 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPREP23469 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPREP23469 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPREP23469 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPREP23469 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPREP23469 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPREP23469 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPREP23469 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPREP23469 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPREP23469 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPREP23469 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPREP23469 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPREP23469 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPREP23469 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPREP23469 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPREP23469 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
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