Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LMNB1P20700 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LMNB1P20700 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LMNB1P20700 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.33■■□□□ 1
LMNB1P20700 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
LMNB1P20700 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LMNB1P20700 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
LMNB1P20700 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LMNB1P20700 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LMNB1P20700 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LMNB1P20700 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LMNB1P20700 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
LMNB1P20700 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
LMNB1P20700 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LMNB1P20700 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LMNB1P20700 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LMNB1P20700 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
LMNB1P20700 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LMNB1P20700 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LMNB1P20700 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LMNB1P20700 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LMNB1P20700 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
LMNB1P20700 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LMNB1P20700 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LMNB1P20700 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LMNB1P20700 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LMNB1P20700 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LMNB1P20700 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LMNB1P20700 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LMNB1P20700 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LMNB1P20700 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LMNB1P20700 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LMNB1P20700 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LMNB1P20700 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LMNB1P20700 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LMNB1P20700 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LMNB1P20700 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LMNB1P20700 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LMNB1P20700 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LMNB1P20700 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LMNB1P20700 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LMNB1P20700 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LMNB1P20700 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LMNB1P20700 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LMNB1P20700 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LMNB1P20700 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LMNB1P20700 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LMNB1P20700 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LMNB1P20700 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
LMNB1P20700 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
LMNB1P20700 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LMNB1P20700 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LMNB1P20700 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LMNB1P20700 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LMNB1P20700 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LMNB1P20700 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LMNB1P20700 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
LMNB1P20700 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LMNB1P20700 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms