Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
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PTPRAP18433 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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PTPRAP18433 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
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PTPRAP18433 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
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PTPRAP18433 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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PTPRAP18433 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRAP18433 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
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