Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms