Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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