Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms