Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms