Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXB7P09629 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms