Protein–RNA interactions for Protein: P08648

ITGA5, Integrin alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA5P08648 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms