Protein–RNA interactions for Protein: P02774

GC, Vitamin D-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCP02774 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GCP02774 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GCP02774 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GCP02774 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GCP02774 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GCP02774 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GCP02774 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GCP02774 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GCP02774 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GCP02774 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GCP02774 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GCP02774 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GCP02774 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GCP02774 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GCP02774 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GCP02774 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GCP02774 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GCP02774 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GCP02774 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GCP02774 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GCP02774 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCP02774 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GCP02774 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCP02774 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCP02774 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCP02774 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCP02774 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCP02774 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCP02774 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCP02774 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCP02774 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCP02774 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCP02774 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCP02774 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCP02774 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCP02774 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCP02774 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCP02774 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCP02774 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCP02774 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCP02774 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCP02774 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCP02774 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCP02774 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCP02774 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCP02774 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCP02774 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCP02774 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCP02774 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GCP02774 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCP02774 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCP02774 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCP02774 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCP02774 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCP02774 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCP02774 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCP02774 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCP02774 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCP02774 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCP02774 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCP02774 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCP02774 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCP02774 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCP02774 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GCP02774 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCP02774 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCP02774 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCP02774 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCP02774 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCP02774 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCP02774 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCP02774 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCP02774 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCP02774 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCP02774 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GCP02774 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCP02774 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCP02774 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GCP02774 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GCP02774 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCP02774 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCP02774 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCP02774 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCP02774 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCP02774 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCP02774 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCP02774 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCP02774 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCP02774 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCP02774 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCP02774 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCP02774 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCP02774 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GCP02774 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCP02774 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCP02774 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCP02774 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GCP02774 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GCP02774 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCP02774 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms