Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms