Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NIPSNAP2O75323 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms