Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms