Protein–RNA interactions for Protein: O60279

SUSD5, Sushi domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD5O60279 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SUSD5O60279 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SUSD5O60279 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SUSD5O60279 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SUSD5O60279 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SUSD5O60279 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SUSD5O60279 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SUSD5O60279 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SUSD5O60279 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SUSD5O60279 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SUSD5O60279 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SUSD5O60279 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SUSD5O60279 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SUSD5O60279 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SUSD5O60279 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SUSD5O60279 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SUSD5O60279 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SUSD5O60279 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SUSD5O60279 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SUSD5O60279 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SUSD5O60279 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SUSD5O60279 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SUSD5O60279 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SUSD5O60279 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SUSD5O60279 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SUSD5O60279 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SUSD5O60279 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SUSD5O60279 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SUSD5O60279 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SUSD5O60279 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SUSD5O60279 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SUSD5O60279 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SUSD5O60279 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SUSD5O60279 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SUSD5O60279 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SUSD5O60279 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SUSD5O60279 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SUSD5O60279 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SUSD5O60279 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SUSD5O60279 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SUSD5O60279 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SUSD5O60279 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SUSD5O60279 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SUSD5O60279 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SUSD5O60279 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SUSD5O60279 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SUSD5O60279 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SUSD5O60279 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SUSD5O60279 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SUSD5O60279 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SUSD5O60279 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SUSD5O60279 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SUSD5O60279 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms