Protein–RNA interactions for Protein: C9J366

IQCJ-SCHIP1, IQCJ-SCHIP1 readthrough, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQCJ-SCHIP1C9J366 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IQCJ-SCHIP1C9J366 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IQCJ-SCHIP1C9J366 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IQCJ-SCHIP1C9J366 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IQCJ-SCHIP1C9J366 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IQCJ-SCHIP1C9J366 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IQCJ-SCHIP1C9J366 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IQCJ-SCHIP1C9J366 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IQCJ-SCHIP1C9J366 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IQCJ-SCHIP1C9J366 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IQCJ-SCHIP1C9J366 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
IQCJ-SCHIP1C9J366 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IQCJ-SCHIP1C9J366 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IQCJ-SCHIP1C9J366 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IQCJ-SCHIP1C9J366 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IQCJ-SCHIP1C9J366 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IQCJ-SCHIP1C9J366 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IQCJ-SCHIP1C9J366 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
IQCJ-SCHIP1C9J366 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
IQCJ-SCHIP1C9J366 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IQCJ-SCHIP1C9J366 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IQCJ-SCHIP1C9J366 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IQCJ-SCHIP1C9J366 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IQCJ-SCHIP1C9J366 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IQCJ-SCHIP1C9J366 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IQCJ-SCHIP1C9J366 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IQCJ-SCHIP1C9J366 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IQCJ-SCHIP1C9J366 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IQCJ-SCHIP1C9J366 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IQCJ-SCHIP1C9J366 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IQCJ-SCHIP1C9J366 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IQCJ-SCHIP1C9J366 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IQCJ-SCHIP1C9J366 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IQCJ-SCHIP1C9J366 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IQCJ-SCHIP1C9J366 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IQCJ-SCHIP1C9J366 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IQCJ-SCHIP1C9J366 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IQCJ-SCHIP1C9J366 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IQCJ-SCHIP1C9J366 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IQCJ-SCHIP1C9J366 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IQCJ-SCHIP1C9J366 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
IQCJ-SCHIP1C9J366 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IQCJ-SCHIP1C9J366 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IQCJ-SCHIP1C9J366 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IQCJ-SCHIP1C9J366 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IQCJ-SCHIP1C9J366 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IQCJ-SCHIP1C9J366 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IQCJ-SCHIP1C9J366 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IQCJ-SCHIP1C9J366 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IQCJ-SCHIP1C9J366 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IQCJ-SCHIP1C9J366 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms