Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DXG7 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DXG7 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DXG7 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DXG7 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DXG7 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DXG7 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DXG7 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DXG7 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DXG7 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DXG7 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DXG7 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DXG7 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DXG7 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DXG7 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DXG7 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DXG7 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DXG7 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DXG7 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DXG7 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DXG7 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DXG7 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DXG7 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DXG7 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DXG7 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DXG7 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DXG7 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DXG7 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DXG7 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DXG7 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DXG7 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DXG7 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DXG7 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DXG7 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DXG7 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DXG7 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DXG7 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DXG7 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DXG7 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DXG7 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DXG7 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DXG7 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DXG7 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DXG7 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DXG7 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DXG7 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DXG7 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DXG7 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DXG7 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DXG7 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DXG7 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DXG7 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DXG7 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DXG7 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DXG7 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DXG7 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DXG7 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DXG7 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DXG7 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DXG7 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DXG7 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DXG7 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DXG7 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DXG7 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DXG7 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DXG7 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DXG7 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DXG7 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DXG7 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DXG7 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DXG7 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DXG7 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DXG7 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DXG7 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DXG7 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DXG7 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DXG7 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DXG7 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DXG7 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DXG7 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DXG7 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
B4DXG7 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
B4DXG7 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
B4DXG7 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
B4DXG7 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
B4DXG7 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
B4DXG7 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
B4DXG7 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
B4DXG7 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
B4DXG7 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
B4DXG7 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
B4DXG7 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
B4DXG7 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
B4DXG7 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
B4DXG7 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
B4DXG7 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
B4DXG7 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
B4DXG7 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
B4DXG7 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
B4DXG7 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms