Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
STRCP1A6NGW2 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
STRCP1A6NGW2 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
STRCP1A6NGW2 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
STRCP1A6NGW2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
STRCP1A6NGW2 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRCP1A6NGW2 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRCP1A6NGW2 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRCP1A6NGW2 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRCP1A6NGW2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRCP1A6NGW2 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRCP1A6NGW2 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRCP1A6NGW2 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRCP1A6NGW2 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRCP1A6NGW2 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRCP1A6NGW2 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRCP1A6NGW2 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRCP1A6NGW2 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRCP1A6NGW2 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRCP1A6NGW2 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRCP1A6NGW2 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRCP1A6NGW2 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
STRCP1A6NGW2 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
STRCP1A6NGW2 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRCP1A6NGW2 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRCP1A6NGW2 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRCP1A6NGW2 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRCP1A6NGW2 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRCP1A6NGW2 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
STRCP1A6NGW2 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
STRCP1A6NGW2 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRCP1A6NGW2 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRCP1A6NGW2 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRCP1A6NGW2 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRCP1A6NGW2 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRCP1A6NGW2 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRCP1A6NGW2 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRCP1A6NGW2 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRCP1A6NGW2 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRCP1A6NGW2 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRCP1A6NGW2 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRCP1A6NGW2 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRCP1A6NGW2 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRCP1A6NGW2 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRCP1A6NGW2 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRCP1A6NGW2 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRCP1A6NGW2 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRCP1A6NGW2 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRCP1A6NGW2 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
STRCP1A6NGW2 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
STRCP1A6NGW2 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
STRCP1A6NGW2 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
STRCP1A6NGW2 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
STRCP1A6NGW2 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
STRCP1A6NGW2 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
STRCP1A6NGW2 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
STRCP1A6NGW2 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
STRCP1A6NGW2 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
STRCP1A6NGW2 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
STRCP1A6NGW2 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
STRCP1A6NGW2 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
STRCP1A6NGW2 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
STRCP1A6NGW2 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
STRCP1A6NGW2 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRCP1A6NGW2 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRCP1A6NGW2 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRCP1A6NGW2 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRCP1A6NGW2 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRCP1A6NGW2 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
STRCP1A6NGW2 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRCP1A6NGW2 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms