Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y7

LYVE1, Lymphatic vessel endothelial hyaluronic acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYVE1Q9Y5Y7 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LYVE1Q9Y5Y7 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms