Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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