Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms