Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC4Q9Y296 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC4Q9Y296 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms