Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HDAC5Q9UQL6 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms