Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
TTF2Q9UNY4 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TTF2Q9UNY4 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms