Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM44

HHLA2, HERV-H LTR-associating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA2Q9UM44 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HHLA2Q9UM44 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HHLA2Q9UM44 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HHLA2Q9UM44 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HHLA2Q9UM44 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HHLA2Q9UM44 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HHLA2Q9UM44 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HHLA2Q9UM44 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HHLA2Q9UM44 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HHLA2Q9UM44 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HHLA2Q9UM44 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HHLA2Q9UM44 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HHLA2Q9UM44 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HHLA2Q9UM44 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HHLA2Q9UM44 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HHLA2Q9UM44 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HHLA2Q9UM44 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HHLA2Q9UM44 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HHLA2Q9UM44 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HHLA2Q9UM44 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HHLA2Q9UM44 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HHLA2Q9UM44 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HHLA2Q9UM44 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HHLA2Q9UM44 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HHLA2Q9UM44 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HHLA2Q9UM44 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HHLA2Q9UM44 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HHLA2Q9UM44 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HHLA2Q9UM44 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HHLA2Q9UM44 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HHLA2Q9UM44 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HHLA2Q9UM44 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HHLA2Q9UM44 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HHLA2Q9UM44 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HHLA2Q9UM44 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HHLA2Q9UM44 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HHLA2Q9UM44 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HHLA2Q9UM44 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HHLA2Q9UM44 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms