Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NRXN1Q9ULB1 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NRXN1Q9ULB1 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms