Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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RABGEF1Q9UJ41 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
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RABGEF1Q9UJ41 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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RABGEF1Q9UJ41 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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RABGEF1Q9UJ41 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
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RABGEF1Q9UJ41 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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RABGEF1Q9UJ41 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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RABGEF1Q9UJ41 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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RABGEF1Q9UJ41 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
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RABGEF1Q9UJ41 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RABGEF1Q9UJ41 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
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